polysom
22.05.2005, 14:18
Da es ja hier sicher auch ein paar Mac-Besitzer gibt die für ihr Hobby, ihr Studium oder ihren Beruf wissenschaftliche Mac-Programme brauchen und es recht müßig ist sich durch die (manchmal) doch eher dürftigen Angebote durchzuwühlen, dachte ich mir man könnte hier mal eine Sammlung mit Links und Informationen machen.
Mit wissenschaftlichen Programmen meine ich alles was man im wissenschaftlichen Bereich an Software brauchen könnte, sei es Chemie, Biologie, Medizin, Elektrotechnik, Geologie, Meterologie, Physik usw. und egal ob Freeware, Shareware oder käufliche Programme.
Ich fange mal mit ein paar ganz hilfreichen (und oft auch wichtigen) Programmen für Biologen und Chemiker an.
Biologie
In der Biologie ist es ganz praktisch dass sehr viele Programme, Informationen usw. kostenlos sind.
ClustalX ( http://www.embl-heidelberg.de/~chenna/clustal/darwin/ )
Dafür existiert auch eine Help-Seite (http://www.infobiogen.fr/doc/ClustalW/clustalx.html).
Mit diesem Programm lassen sich mehrere Sequenzen (müssen in ein und dem selben Dokument, getrennt durch einen Anstand vorliegen) laden und damit ein Alignment durchführen.
Dieses Programm ist Freeware.
4Peaks (http://www.mekentosj.com/4peaks/)
Ist ein sehr nettes Programm um Sequenzen zu visualisieren.
Es enthält außerdem einige ganz hilfreiche Features und ist in deutscher Sprache erhältlich.
Dieses Programm ist auch Freeware.
FinchTV (http://www.geospiza.com/finchtv/help/)
Dieses Programm ist vergleichbar mit 4Peaks, enthält aber weniger Features und ist in Englisch.
Dieses Programm ist aber auch Freeware.
Chemie
Für Chemiker ist es in der Regel wichtig ein Programm zu haben mit dem man Strukturformeln in Text-Dokumente (z.B. Protokolle) bekommt.
Leider gibt es für OSX da recht wenig, für OS 9-8 existiert z.B. das (unter Chemikern) bekannte ISIS Draw (http://www.mdli.com/downloads/downloadable/index.jsp) .
Für OSX gibt es da recht wenig, zu nennen wäre hier z.B.
XDrawChem (http://xdrawchem.sourceforge.net/)
Mit diesem Programm lassen sich 2D-Strukturformeln zeichnen, allerdings besitzt es noch ein paar Macken.
Sehr hilfreich ist aber auch das Untermenü „Werkzeug“ mit dem sich z.B. Spektren berechnen lassen.
Wichtig anzumerken ist, dass das Programm nur läuft wenn man Trolltech's Qt C++ Framework (http://naranja.umh.es/~atg/) installiert hat (Qt steht hier NICHT für Quicktime).
Trolltech's Qt und XdrawChem sind Freeware.
Biologie und Chemie
In der Chemie und Biologie interessieren einen häufig auch die 3D-Strukturen seiner Substanz (Chemikalie, Protein usw.).
Dafür gibt es unter OSX einige ganz gute Programme.
iMol (http://www.pirx.com/iMol/index.shtml)
Dies ist ein guter 3D Visualizer für OSX mit dem man die in der Biologie häufig benutzen Protein-Datenbanken (.pdb) und außerdem XYZ, MOL2, HIN, CAR, ALC, und BIO öffnen kann.
Sehr gut gefällt mir die Stereo-Funktion mit der sich die Moleküle mit einer Rot-Blau-Brille (bzw. Rot-Grün) räumlich betrachten lassen.
Leider ist das Zoomen der Moleküle etwas schwer, so wird zum Beispiel das Rechte-Maustasten-Zoomen nicht unterstützt.
Die Moleküle lassen sich aber in verschiedenen Modi darstellen und in jede Richtung drehen.
Dieses Programm ist Freeware.
JMol (http://jmol.sourceforge.net/)
Dies ist ebenfalls ein 3D Visualizer, der auf verschiedenen Plattformen läuft, da es sich hierbei um eine Java-Applikation handelt.
Es lassen sich eine Vielzahl von Formaten öffnen u.a. pdb-Dateien.
Auch hier lassen sich die Moleküle frei im Raum drehen, es gibt aber keine Stereo-Funktion.
Dieses Programm ist Freeware.
PyMol (http://delsci.com/rel/0_98/)
Dies ist ebenfalls ein 3D Visualizer für pdb-, mol- und andere Dateiformate.
Hier wird das Rechte-Maustasten-Zoomen unterstützt, es gibt hier eine Stereo-Funktion die aber nicht mit farbigen Brillen arbeitet.
Es gibt hier reichhaltige Einstell- und Visualisierungsmöglichkeiten.
Dieses Programm ist auch Freeware.
So, das wars dann erstmal von meiner Seite, ich hoffe das hier bald noch eine Menge mehr Programme hinzukommen.
PS: Ich habe jedes Programm verlinkt, dies ist hier bei mir (unter der Vorschau) schwer zu erkennen, darum schreib ichs mal dazu.
Nicht dass sich jemand im Internet wundsucht ;)
Mit wissenschaftlichen Programmen meine ich alles was man im wissenschaftlichen Bereich an Software brauchen könnte, sei es Chemie, Biologie, Medizin, Elektrotechnik, Geologie, Meterologie, Physik usw. und egal ob Freeware, Shareware oder käufliche Programme.
Ich fange mal mit ein paar ganz hilfreichen (und oft auch wichtigen) Programmen für Biologen und Chemiker an.
Biologie
In der Biologie ist es ganz praktisch dass sehr viele Programme, Informationen usw. kostenlos sind.
ClustalX ( http://www.embl-heidelberg.de/~chenna/clustal/darwin/ )
Dafür existiert auch eine Help-Seite (http://www.infobiogen.fr/doc/ClustalW/clustalx.html).
Mit diesem Programm lassen sich mehrere Sequenzen (müssen in ein und dem selben Dokument, getrennt durch einen Anstand vorliegen) laden und damit ein Alignment durchführen.
Dieses Programm ist Freeware.
4Peaks (http://www.mekentosj.com/4peaks/)
Ist ein sehr nettes Programm um Sequenzen zu visualisieren.
Es enthält außerdem einige ganz hilfreiche Features und ist in deutscher Sprache erhältlich.
Dieses Programm ist auch Freeware.
FinchTV (http://www.geospiza.com/finchtv/help/)
Dieses Programm ist vergleichbar mit 4Peaks, enthält aber weniger Features und ist in Englisch.
Dieses Programm ist aber auch Freeware.
Chemie
Für Chemiker ist es in der Regel wichtig ein Programm zu haben mit dem man Strukturformeln in Text-Dokumente (z.B. Protokolle) bekommt.
Leider gibt es für OSX da recht wenig, für OS 9-8 existiert z.B. das (unter Chemikern) bekannte ISIS Draw (http://www.mdli.com/downloads/downloadable/index.jsp) .
Für OSX gibt es da recht wenig, zu nennen wäre hier z.B.
XDrawChem (http://xdrawchem.sourceforge.net/)
Mit diesem Programm lassen sich 2D-Strukturformeln zeichnen, allerdings besitzt es noch ein paar Macken.
Sehr hilfreich ist aber auch das Untermenü „Werkzeug“ mit dem sich z.B. Spektren berechnen lassen.
Wichtig anzumerken ist, dass das Programm nur läuft wenn man Trolltech's Qt C++ Framework (http://naranja.umh.es/~atg/) installiert hat (Qt steht hier NICHT für Quicktime).
Trolltech's Qt und XdrawChem sind Freeware.
Biologie und Chemie
In der Chemie und Biologie interessieren einen häufig auch die 3D-Strukturen seiner Substanz (Chemikalie, Protein usw.).
Dafür gibt es unter OSX einige ganz gute Programme.
iMol (http://www.pirx.com/iMol/index.shtml)
Dies ist ein guter 3D Visualizer für OSX mit dem man die in der Biologie häufig benutzen Protein-Datenbanken (.pdb) und außerdem XYZ, MOL2, HIN, CAR, ALC, und BIO öffnen kann.
Sehr gut gefällt mir die Stereo-Funktion mit der sich die Moleküle mit einer Rot-Blau-Brille (bzw. Rot-Grün) räumlich betrachten lassen.
Leider ist das Zoomen der Moleküle etwas schwer, so wird zum Beispiel das Rechte-Maustasten-Zoomen nicht unterstützt.
Die Moleküle lassen sich aber in verschiedenen Modi darstellen und in jede Richtung drehen.
Dieses Programm ist Freeware.
JMol (http://jmol.sourceforge.net/)
Dies ist ebenfalls ein 3D Visualizer, der auf verschiedenen Plattformen läuft, da es sich hierbei um eine Java-Applikation handelt.
Es lassen sich eine Vielzahl von Formaten öffnen u.a. pdb-Dateien.
Auch hier lassen sich die Moleküle frei im Raum drehen, es gibt aber keine Stereo-Funktion.
Dieses Programm ist Freeware.
PyMol (http://delsci.com/rel/0_98/)
Dies ist ebenfalls ein 3D Visualizer für pdb-, mol- und andere Dateiformate.
Hier wird das Rechte-Maustasten-Zoomen unterstützt, es gibt hier eine Stereo-Funktion die aber nicht mit farbigen Brillen arbeitet.
Es gibt hier reichhaltige Einstell- und Visualisierungsmöglichkeiten.
Dieses Programm ist auch Freeware.
So, das wars dann erstmal von meiner Seite, ich hoffe das hier bald noch eine Menge mehr Programme hinzukommen.
PS: Ich habe jedes Programm verlinkt, dies ist hier bei mir (unter der Vorschau) schwer zu erkennen, darum schreib ichs mal dazu.
Nicht dass sich jemand im Internet wundsucht ;)